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12bet网址:提高蛋白质结构分析的效率

时间:2022/11/17 7:15:21   作者:   来源:   阅读:2   评论:0
内容摘要:马建鹏说"alpha fold 2"远不能取代结构生物学家。目前,它只能预测单链蛋白质的结构,而不能预测多链蛋白质结构的功能。此外,在单链蛋白质预测方面,人工智能预测基于对已知蛋白质结构的比较学习,在预测同源蛋白质结构方面更加准确。然而,当涉及到"孤...
马建鹏说"alpha fold 2"远不能取代结构生物学家。目前,它只能预测单链蛋白质的结构,而不能预测多链蛋白质结构的功能。此外,在单链蛋白质预测方面,人工智能预测基于对已知蛋白质结构的比较学习,在预测同源蛋白质结构方面更加准确。然而,当涉及到"孤儿序列"(独特氨基酸序列),"alpha fold 2"往往是无法准确预测的。

此外,在蛋白质侧链预测中,"alpha fold 2"还有很大的提升空间。2021年,复旦大学复杂系统多尺度研究所在英国发表了一篇论文,报道了"他们开发的预测精度高于"alpha折叠2"蛋白质侧链预测。据报道,蛋白质的三维结构是由主链和侧链构成的。药物分子与蛋白质的结合大部分是通过与氨基酸侧链的相互作用实现的,因此人工智能系统对侧链结构的准确预测对新药研发具有重要价值。12bet网址

可见,人工智能不会让结构生物学家"失业"。两者之间的关系不是替代关系,而是互补关系。Alphafold 2对于闫宁这样一流的实验结构生物学家来说是不错的,"他说马建鹏说,实验结构生物学家也需要使用计算机建模。alphafold 2和opus fold等软件可以加快建模速度,提高蛋白质结构分析的效率。

如今,"干湿"结构已经成为一种趋势。长期以来,干燥实验室"计算生物学一直是生物学的辅助作用。随着人工智能的兴起,这种配角逐渐成长为主角。它与"湿式实验室"来探索生命分子结构的奥秘。

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